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用途基因功能研究、免/殺傷/增殖等、抗體活性篩選（細(xì)胞水平的結(jié)合和阻斷）、CAR分子的殺傷活性評(píng)價(jià)。材料與儀器（以慢pMSCV載體為例）包含目的基因和eGFP-Tag的pMSCV質(zhì)粒、帶有eGFP-Tag的pMSCV空載質(zhì)粒、GAG質(zhì)粒、VSV質(zhì)粒、Puromycin、Polybrene、Lipo3000、HEK293T細(xì)胞、opti-MEM、DMEM、FBS、雙抗、μm的濾膜、熒光顯微鏡等。步驟1、基因的構(gòu)建1)根據(jù)目的基因mRNA編碼區(qū)設(shè)計(jì)引物，分別在引物兩端加入酶切位點(diǎn)EcoRI和BglII。2)從細(xì)胞中提取目的基因mRNA，然后逆轉(zhuǎn)錄成cDNA，然后從cDNA里面用引物把目的基因的CDS區(qū)擴(kuò)增出來。PCR擴(kuò)增出帶有酶切位點(diǎn)的目的基因編碼區(qū)序列，連接至pMD19-T載體后轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α，分別進(jìn)行菌落PCR鑒定和酶切鑒定。3)使用EcoRI和BglII雙酶切下目的基因序列，電泳割膠回收純化，連接到pMSCV-eGFP載體。再次轉(zhuǎn)化到感受態(tài)DH5α，菌落PCR鑒定和酶切鑒定成功后，送至公司測序、鑒定。4)鑒定成功后，將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中，并進(jìn)行無內(nèi)質(zhì)粒抽提。GAG質(zhì)粒和VSV質(zhì)粒同樣可以轉(zhuǎn)化至感受態(tài)DH5α中，并進(jìn)行無內(nèi)質(zhì)粒抽提。質(zhì)粒抽提后冷凍于-20℃保存。2、慢包裝1)使用DMEM完全培養(yǎng)基培養(yǎng)6cm皿HEK293T至匯合度為70~80%。流式細(xì)胞周期檢測試劑盒是一種用于研究細(xì)胞周期的重要工具。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一，目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時(shí)間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識(shí)別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理，然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫測序。對(duì)于無修飾的位點(diǎn)，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進(jìn)行分析（圖3）。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)裸鼠皮下成瘤模型造模意義.

圖2MAZTER-Seq實(shí)驗(yàn)流程圖圖3MAZTER-MINE分析m6A示意圖接下來作者便是要驗(yàn)證這一新方法的可行性了。在酵母中敲除IME4的情況下，檢測到的剪切效率高于野生型（剪切效率高低m6A水平），m6A抗體富集后的樣品剪切效率也低于未富集的Input組。整體水平可靠，那檢測的特異性位點(diǎn)是否準(zhǔn)確呢？作者也將該方法檢測到的新甲基化位點(diǎn)使用放射標(biāo)記層析檢測，發(fā)現(xiàn)預(yù)測的位點(diǎn)準(zhǔn)確存在而且與剪切效率相符合。如圖5所示。而圖6中，作者則是與m6A抗體IP的方法進(jìn)行了比較，也證實(shí)了這一方法的可行性。圖5MAZTER-Seq檢測結(jié)果驗(yàn)證圖6MAZTER-Seq與m6A-Seq比較分析此外，后文中作者也在大規(guī)模的CRISPR-Cas9改變m6A狀態(tài)和酵母減數(shù)分裂模型中檢測了MAZTER-Seq這一系統(tǒng)；并進(jìn)一步通過這一方法檢測了哺乳動(dòng)物不同細(xì)胞間m6A水平的保守性；也探究了去甲基化酶FTO對(duì)整體m6A甲基化水平的影響等。這里小編主要給大家分享這一新技術(shù)，其他部分暫不過多分析了。新的技術(shù)能拓展我們的研究內(nèi)容；對(duì)于這一技術(shù)。

小鼠尾尖用酒精擦拭尾巴，引起輕微的血管擴(kuò)張；用無菌手術(shù)刀、刀片或鋒利的剪刀，快速截?cái)嘈∈笪布?-2毫米。如果需要多次，之后每次需截除2-3毫米；從尾部像尾尖方向按摩，增加血流；用采集血液；結(jié)束后，按壓傷口或使用止血?jiǎng)﹣碇寡?；每次量大約可達(dá)。小鼠眼球取血單手保定好小鼠；必要時(shí)剪掉小鼠胡須，防止污染血液；輕壓取血側(cè)眼部皮膚，使眼球充血突出；用彎頭鑷夾取眼球并快速在摘?。煌瑫r(shí)用左手中指輕按小鼠心臟部位，以加快心臟泵血速度；當(dāng)血液流盡時(shí)，用脫臼法處死小鼠；大鼠眼眶取血先將小鼠進(jìn)行麻醉，大鼠翻正反射消失時(shí)不在繼續(xù)麻醉；抗凝處理過的玻璃毛細(xì)采樣管，掰成2-3厘米長度；右手食指和拇指輕按眼眶兩側(cè)皮膚，使眼球突出，毛細(xì)管從內(nèi)側(cè)的眼球與眼瞼的縫隙處進(jìn)入，輕輕旋轉(zhuǎn)毛細(xì)管，稍微深入眼球后上方，血液流速快的時(shí)候4-5滴即可，溫柔的將毛細(xì)管取出；用棉簽按壓大鼠眼眶止血，每次可取血50-100微升，將血液放入冰盒中保存。小鼠心臟取血先將小鼠麻醉，稍靠右側(cè)平躺在手術(shù)板上固定；左側(cè)第三四根肋骨間觸摸心臟，跳動(dòng)明顯，慢慢進(jìn)針；針有回血停止進(jìn)針，開始取血；一次可以300到500微升，小鼠存活，放到加熱墊上待小鼠蘇醒后放入籠中。盡管存在挑戰(zhàn)，動(dòng)物疾病模型的發(fā)展前景仍然值得期待。

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾，在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性，剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)了METTL3（甲基轉(zhuǎn)移酶3），一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶，在人肝細(xì)胞（HCC）和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上，METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖，遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外，使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng)，內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR，作者確定了SOCS2（細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子）作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2?？傊?，METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此，作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。動(dòng)物造模 | 膿毒癥造模方法之CLP造模法。黑龍江大鼠科研技術(shù)服務(wù)分離

protocol 分享｜過表達(dá)細(xì)胞株的構(gòu)建。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)

原理以慢病毒包裝為例，主要包括3個(gè)質(zhì)粒：質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA)，但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒，其同時(shí)含有目的基因和報(bào)告基因，psPAX2是可以表達(dá)慢病毒外殼的質(zhì)粒，其表達(dá)產(chǎn)物可通過粘附機(jī)制更易穿過細(xì)胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒，通過脂質(zhì)體進(jìn)行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細(xì)胞基因組中，宿主基因組在表達(dá)時(shí)，隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進(jìn)入細(xì)胞后，其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA，該基因再整合到靶細(xì)胞的基因組中，完成轉(zhuǎn)染過程。因?yàn)橘|(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達(dá)目的基因卻不能表達(dá)出病毒的外殼和膜蛋白成分，因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細(xì)胞能反復(fù)增殖，故對(duì)宿主細(xì)胞是無害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細(xì)胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生，包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS，對(duì)數(shù)期293T細(xì)胞，細(xì)胞計(jì)數(shù)器，病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例：psPAX2/)，轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000)，Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細(xì)胞鋪板取對(duì)數(shù)生長期的293T細(xì)胞，用的胰蛋白酶消化293T細(xì)胞，計(jì)數(shù)。若是10cm大皿，建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細(xì)胞均勻鋪入。若是6孔板。海南小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)